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PhysChem Suite LogP (中文)

使用ACD / LogP进行分配系数计算

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LogP (中文) Overview

从化学结构预测辛醇-水分配系数

ACD / LogP可根据结构预测分配系数(疏水性的量度)

使用ACD / LogP可以:

  • 计算中性分子的分配系数(logP
  • 识别结构的亲水性和疏水性片段
  • 通过实验测量来训练算法
Benefits

LogP属性计算器

Accurate, Reliable Results

  • 通过可靠性指标,数据库中类似结构的显示以及原始实验数据的文献参考轻松评估结果的准确性
  • Leverage the knowledge in the extensive training database (>12, 000 compounds)

更深入的见解

  • 轻松创建散点图,浏览,过滤,排序,排序和优先排序化合物库

三合一LogP计算器

  • 一种软件应用程序中三种算法的结果:经典,GALAS和Consensus

使用内部数据可自定义

  • 从商业产品获得内部模型的准确性。使用实验测得的logP值将适用范围扩展到专有化学空间。
  • 为每个项目建立培训集,以提高准确性

Calculate the octanol-water distribution coefficient (logP) from chemical structure

See experimental values for similar structures.

Choose from three prediction algorithms. The Classic algorithm provides the calculation protocol

How it Works

LogP的快速预测

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  • 1 绘制/导入结构
  • 2 查看结果并做出决定
  • 3 报告为PDF或复制/粘贴
Product Features

分配系数(LogP)计算器功能

  • 根据结构预测logP(在应用程序内绘制,或从第三方图形包复制/粘贴); SMILES字符串; InChI代码;导入的MOL,SK2,SKC或CDX文件;或在内置字典中按名称搜索
  • 三种预测算法:经典(默认计算器),GALAS(全局,根据相似性进行局部调整)和基于其他两个模型的共识logP了解算法
  • 不同模型中预测准确性的估计
    • 经典的
      • 以最终logP值和增量贡献的95%置信区间交付结果
      • 内部培训资料库中提供了化合物的所有可用实验数据和文献参考
    • GALAS
      • 可靠性指标
      • 在训练库中显示5个最相似的结构,并提供实验值和参考文献
    • Consensus

      • 在训练库中显示5个最相似的结构,并提供实验值和参考文献

  • 详细的计算协议列出了所有贡献的官能团,碳原子以及通过脂肪族,芳香族和乙烯基系统的相互作用(经典)
    • 单击协议条目以突出显示结构上的相应实体
  • 分子的颜色突出显示以突出​​亲水/疏水子结构(GALAS)
  • 计算化合物组或化合物库的logP属性,并使用内置工具对结果进行排序,过滤,绘图和排名。
    • 设置用户定义的标签颜色
    • 数字过滤结果
    • 按升序/降序对结果进行排序
  • 查看历史记录中先前计算的值的结果
  • 将结果报告为PDF
  • 用实验值训练模型,以改善对专有化学空间的预测
  • Train the model with experimental values to improve predictions for proprietary chemical space
    • 创建并选择不同的训练库进行计算,或切换到内置算法
Deployment/Integration Options

选择适合您的部署选项

桌面版

在单台计算机上安装ACD / LogP以访问客户端,该客户端提供了完整的图形用户界面和对算法训练工具的访问。

批量版

用最少的用户干预即可计算成千上万种化合物的logP。批处理部署与Microsoft Windows和Linux兼容。企业内部网或工作流工具(例如Pipeline Pilot)的插件。

Percepta Portal网页版

使用基于浏览器的应用程序来预测logP。可以使用KNIME集成组件。托管在您的公司Intranet或云上。适用于Linux和Windows OS。

More Reasons to Use LogP

有关分配系数预测ACD / LogP的技术信息

可训练的LogP计算器

您可以使用实验测得的logP值来训练ACD / LogP中的算法。提高预测准确性,并使模型与您的化学空间或项目更相关。

即使您不是计算机化学家或软件工程师,也可以对Classic和GALAS算法进行培训。共识模型自动使用应用于基础算法的训练数据.

如何计算logP值?

经典算法

基于> 12,000个实验logP值,经典算法使用了隔离碳的原理。

GALAS算法

GALAS模型是全局的,可根据相似性进行局部调整。该算法基于训练的> 11,000种化合物,并提供logD值,并使用来自最相似化合物的数据进行调整。

Consensus Model

Consensus模型同时使用经典算法和GALAS算法。每种算法在其最可靠执行的化学空间区域中的权重都更大。

当计算的LogP比实验更准确时

在以下情况下,预测的logP可能比实验测得的精度更高:

  • logP值超出了传统实验获得的可靠可测量范围(+8到-3.
  • 存在互变异构形式。在大多数情况下,无法测量每个互变异构体的logP值。
  • 化合物包含酸性和碱性基团(例如氨基酸,肽,核苷)。由于这些分子在任何给定的pH值下均以各种离子形式存在,因此,工会化形式的浓度可以忽略不计。

关于LogP的信息

什么是分配系数?

分配常数(P)是中性(不带电)分子的亲水性(’water-loving’)或疏水性(’water-fearing’)的量度。它代表了化合物在这两个不混溶相(通常是辛醇和水)中差异溶解的趋势。分配系数也称为Kow和辛醇/水分配系数。

LogP预测模型将该值估计为对数比(logP,ClogP或AlogP)。分配系数充当化合物疏水性的定量描述。

logP和logD有什么区别?

与logP(或clogP)相似,logD也是疏水性的描述词,但不仅限于描述中性分子。 LogD是考虑到pH依赖性的可电离化合物疏水性的量度。

在研发中如何使用logP值?

疏水性(由logP确定)可以帮助解释或预测化合物的行为,并在许多行业中有用:

药物-LogP帮助药物化学家评估药物的相似性;在药代动力学中,它可以帮助确定ADME概况-药物的吸收能力,成功达到预期目标,被代谢和排泄的能力;并在药效学上了解靶标受体的结合。

农用化学品-Kow值用于帮助开发除草剂和杀虫剂。分区值有助于确定化合物是否会到达其预期的作用位点以及环境污染的可能性。

环境-分配系数用于模拟溶解的疏水性有机物在土壤和地下水中的迁移,以帮助评估水道污染以及对动物和水生生物的毒性。

消费产品-在化妆品,染料,家用清洁剂和许多其他产品的配方中使用了对分区的理解。

 

What's New!

LogP 2022版的新增功能

  • pH Selector tool to help you select the optimal pH for chromatographic separations
  • Capability to import training libraries into PhysChem Suite in all major file types
  • Streamlined “Context Help”
Learn More about LogP

Additional resources are available on our English web site