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PhysChem Suite LogD (中文)

用ACD / LogD计算分配系数

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LogD (中文) Overview

根据结构预测分配系数

ACD / LogD可根据结构预测辛醇-水的分配系数(或表观分配系数)

使用ACD / LogD可以:

  • 计算各种pH下有机分子的所有化合物种类的分布系数值(logD
  • 查看与生理相关的pH值或感兴趣的离散pH值的logD结果
  • 用logP和pKa的实验测量值训练算法
Benefits

LogD属性计算器中需要的一切

快速,准确和可靠

  • pKa和logP的行业标准计算器为准确logD计算提供了基础
  • 利用所提供的信息评估结果的准确性-可靠性指标,数据库中五个最相似的结构以及原始实验数据的文献参考

更深入的见解

  • 通过自动生成的logD与pH的关系图了解分子的行为
  • 轻松创建散点图,浏览,过滤,排序,排序和优先化化合物

几合一计算器

  • G通过更改logP和pKa预测算法的组合来预测logD,可以获得几个logD值。从三种logP算法(经典,GALAS和共识)和两种pKa算法(经典和GALAS)中进行选择。

使用内部数据可自定义

  • 从商业产品获得内部模型的准确性。使用实验测得的logP和pKa值将适用范围扩展到专有化学空间。
  • 为每个项目建立一个培训集,以提高准确性

Calculate logD from chemical structure. See values at physiologically relevant pH, or define pH values of interest

The software automatically identifies tautomers—choose to use the major or canonical form.

How it Works

LogD的快速预测

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  • 1 绘制/导入结构
  • 2 查看结果并做出决定
  • 3 报告为PDF或复制/粘贴
Product Features

分配系数(LogD)计算器功能

  • 根据结构预测logD(在应用程序内绘制,或从第三方图形包复制/粘贴); SMILES字符串; InChI代码;导入的MOL,SK2,SKC或CDX文件;或在内置字典中按名称搜索
  • 从多种logP和pKa算法中选择(默认值:logP共识,pKa经典)
  • 查看不同pH值的logD
    • 生理相关值(1.7,4.6,6.5,7.4,8.0)
    • 在感兴趣的pH值上单击并拖动以绘制logD(logD与pH)
    • 在特定的pH值上添加/删除预测
  • 计算化合物组或化合物库的logD属性,并使用内置工具对结果进行排序,过滤,绘图和排名。
    • 设置用户定义的标签颜色
    • 数字过滤结果
    • 按升序/降序对结果进行排序
  • 查看历史记录中先前计算的值的结果
  • 将结果报告为PDF
  • 使用logP和pKa的实验值训练模型,以改善对专有化学空间的预测chemical space
    • 创建并选择不同的训练库进行计算,或切换到内置算法
Deployment/Integration Options

选择适合您的部署选项

桌面版

在单台计算机上安装ACD / LogD以访问客户端,该客户端提供完整的图形用户界面和对算法训练工具的访问

批量版

用最少的用户干预即可计算成千上万种化合物的logD。批处理部署与Microsoft Windows和Linux兼容。企业内部网或工作流工具(例如Pipeline Pilot)的插件。

Percepta Portal网页版

使用基于浏览器的应用程序来预测logD。可以使用KNIME集成组件。托管在您的公司Intranet或云上。适用于Linux和Windows。

More Reasons to Use LogD

有关分配系数预测的技术信息

可训练的LogD计算器

通过训练底层的logP和pKa模型来训练logD算法。提高预测精度并扩大模型在新型化学空间中的适用性。


如何计算logD值?

分布系数(logD)是两相(辛醇和水性缓冲液)的每相中所有形式的化合物(中性和离子化)的所有浓度之和的比率。每种形式在水性缓冲液和正辛醇之间分配的趋势不同。其特征在于与pH无关的分配系数logP物种(例如,logP0,logP-,logP2 +等)。

logD预测算法基于logP的碎片算法(中性形式)和一系列校正因子来计算分配常数,同时考虑电离的类型和位置。 LogD是所有分子种类分布的函数,由pKa预测的pH值控制.

ACD / LogD提供了各种用于预测logP和pKa值的算法,并且可以选择(并将它们的默认组合)用于预测logD

有关LogD的一般信息

什么是分配系数?

分布常数(D),也称为表观分配系数,是可电离分子的亲水性(“偏爱水”)或疏水性(“偏怕水”)的量度。它代表了化合物在两个不混溶相(通常是辛醇和水性缓冲液)中差异溶解的趋势,同时考虑了基于pH值的离子化物质的分布。也称为分布系数。例如,请参见甲胺在辛醇-水中的分配以及分布常数如何描述该分配:

LogD预测模型将分布常数估计为对数比(logD或ClogD)。分布系数充当可电离化合物的亲脂性(或疏水性)的定量描述。


如何使用logD值?

药物发现-LogD值用于了解和预测活性化合物在生理条件下的体内行为。由于整个胃肠道的pH环境差异很大(从胃中的1.4到结肠中的8),了解药物在生理条件下的亲脂性/亲水性有助于科学家了解在实质上不同的化学环境下的行为。

LogD值在色谱方法开发中也很重要(用于选择合适的pH和分离柱);在农业化学中开发除草剂和杀虫剂;在环境化学中了解污染物的行为,并在许多其他消费产品的开发中。

What's New!

ACD / LogD 2022版的新增功能

  • Calculate the pH value at which a molecule has zero net charge (the isoelectric point)
  • Activate/deactivate extended tool tips from the Expert Panel
  • Add Similarity Index (SI) and the Data-Model Consistency Index (DMCI) values for predicted results, in the Spreadsheet Workspace, for a better understanding of their reliability
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Additional resources are available on our English web site