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Structure Elucidator Suite (中文)

Structure Elucidator Suite解析复杂化合物结构

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Structure Elucidator Suite (中文) Overview

鉴定出符合您NMR和MS谱图的最佳结构

ACD/Structure Elucidator Suite是业界领先的计算机辅助结构解析 (CASE)软件解决方案. 为复杂有机化合物结构的从头解析提供了可靠工作流程和准确结果.

Structure Elucidator Suite可应用于:

  • 使用NMR和其它分析数据确定结构
  • 生成符合NMR和MS数据的所有备选结构
  • 对生成的结构排序确定最有可能的那个
  • 使用NOSEY/ROESY数据确定平面结构的3D构型
  • 排重先前已知的结构
  • 搜索片段数据库获得片段信息或对部分已知的结构手动定义结构片段
  • 报告最终的结构并将SDFiles添加到预测数据库中
Benefits

为什么是Structure Elucidator Suite?

充分确定结构和谱图之间的关系

  • Structure Elucidator Suite采用业界领先的CASE技术，通过完整的从头解析过程和量化的结果反馈形式，从实验数据获得正确的复杂化合物化学结构

自动生成符合数据结构的2D映射图

  • 查看由NMR和MS数据生成的分子连接图(MCD)
  • 根据你的知识和经验编辑MCD，生成与你的数据一致的所有化学结构

轻松排序，排名，和过滤结构

  • >ACD/Labs在结构表征和核磁共振预测方面有24年的专业经验，并不断开发创新软件
  • Structure Elucidator在同行评审的出版物中被引用次数超1000次

从2D平面结构生成3D立体结构

  • 使用NOESY/ROESY数据，可视化并为您的结构选择结构的最佳3D构型

不要在以前解析过的结构上再浪费时间

  • 搜索内部数据库的200万结构片段和425,000化学结构以获得部分或完全匹配的结构信息，完全匹配即为以前鉴定过的化合物

自动整理数据，更快地获得解析结果

  • 在不依赖仪器的软件平台上，从所有分析数据(如MS、IR等)中提取信息，有效地解决结构问题

轻松排序，排名，和过滤结构

  • 实时查看排名和生成的结构，以快速选择与数据吻合度最佳的结构

Measure and fit residual dipolar couplings to 3D conformers to determine stereochemistry.

Search through available knowledge to avoid duplication of effort. Structure Elucidator allows spectral searches of PubChem and ACD/Labs databases.

Efficiently determine the best structure using DP4 metrics. This approach calculates the Match Factor based on the normalized multiplication of probabilities of each assigned atom (13C or 1H).

A molecular formula (MF) can be entered or determined from the MS data. A Molecular Connectivity Diagram (MCD) is then created based on the spectra and MF.

How it Works

结构解析工作流程

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  • 1 选择和处理您的NMR数据(相位，标峰，归属，对齐1D与2D谱图，等等)
  • 2 从高分辨质谱获得分子式(MF)
  • 3 自动生成分子连接图(MCD)
  • 4 根据之前的结构知识编辑MCD
  • 5 软件根据用户定义的限制和输入数据生成所有可能的结构
  • 6 自动排序和筛选候选结构列表，以确定最佳匹配的结构
Customer Reviews
“We have just used ACD/Labs to solve an amazing structure. It worked like a dream...we just used 1H, 13C, HSQC and HMBC, manually picked the peaks (they were very well resolved) which took about 10 minutes. The software solved the structure in less than 30 seconds, producing just one possible structure which was the correct one! It's an organic molecule with an unprecedented carbon backbone, and I think we really would have struggled to work it out ourselves.”

Dr. John Lowe
NMR Spectroscopist/Academic Lab Co-ordinator, University of Bath

市面上使用最多的CASE软件

经过二十多年的发展，研究人员使用structure Elucidator Suite从头解析出了成千上万的天然和合成化合物的结构，并在计算机辅助结构解析的数百篇同行评审的文章中出现。 其中有一篇访问次数最多的文章发表在《化学信息学杂志》上，题为“分子结构解析的计算机辅助方法——实现光谱学家的梦想”

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Product Features

Structure Elucidator的特色

  • CASE系统推荐使用最小数据类型组合为1D 1H, COSY, 1H–13C HSQC, 1H–13C HMBC
  • 高分辨质谱自动生成分子式(MF)
  • 支持所有主要类型的分析数据，如质谱和红外光谱
  • 从检索内部片段库着手解析结构
  • 由起始原料或同系物结构自动获得片段结构
  • 根据所提供的信息和数据情况自动评估每个问题的难度
    • 对于真正复杂的数据，较高的难度意味着较长的解释时间
    • 困难的任务表明某些原子在标峰时可能存在错误或相关信号不足
  • MCD提供了原子及其相关性的平面信息。 它是自动生成的，可以手动编辑
    • 它是生成结构的起点
    • 根据H和C的化学位移信息获得不同的碳杂化状态并使用用不同的颜色加以区别
  • 可以在MCD图中更新化学键的禁止和强制连接方式（包括或排除已知的结构片段、官能团、环数目等)
  • 该软件根据实验数据和MF中观察到的相关信号生成一系列的可能结构
    • 以tile, table, list, 或 one record模式，实时查看生成的结构
  • 以偏差值来表示每个候选结构的误差. 误差是根据实验和计算的化学位移差的平均值计算出来的.
    • 基于偏差值来排序所有候选结构
    • 化学位移预测方法有三种:迭代、基于HOSE CODE和神经网络
  • DP4可用于评估候选结构和数据之间的匹配情况，是基于每个原子(C或H) 的概率倍乘法计算的.
    • DP4指标可以帮助在不明确的情况下识别候选结构中的正确结构
  • 利用NOESY和ROESY谱图，从平面(2D)结构(构成)生成一个可能的3D构型
  • 使用NOE数据查看空间相关性和立体化学键相关信息
  • 获得几何优化的潜在构象的数量的即时信息
  • 自动生成一个结果列表，包括所有可能构象的无偏向性排名，他们的相对能量，浓度，平均距离，并与NOESY/ROESY实测数据的吻合度
  • 通过检索PubChem和Structure Elucidator Suite本地数据库(包含> 9900万条条目) 来识别之前定性过的化学结构。 该数据库包括ACD/Labs预测的C NMR化学位移、结构和PubChem ID号
  • 检索超过220万个结构片段的内部结构片段库，获得类似结构或片段作为解析结构的基础
  • 执行手动和/或自动数据处理:傅里叶变换，校准，标峰，积分，谱峰分析等.
    • A将化学结构关联到谱图上，实时反馈谱峰原子归属结果
    • 同一数据集下同步标峰和归属所有谱图
  • 使用NOESY/ROESY谱图进行构象优化和分析
    • SD(*.sdf) 文件导出生成的构象异构体结构和数据分析结果，可供第三方软件进一步处理
    • SD文件导入第三方程序生成的构象异构体结构。 进一步对导入的构象异构体进行分析，将其与NOESY和ROESY谱图进行比对分析
  • 数值化的匹配度表示起始结构与实验数据的匹配程度
  • 基于提出起始的结构和实验数据，提供一定数量的替代结构以及其匹配度数据
  • 软件以实验数据为基础，实时提供所有可能的替代结构和匹配度，无需人工干预
  • 实验光谱，化学结构，分析结果，用户数据和注释数据库化
    • 使用Group Macro批处理工具一步将数千个谱图推送到数据库中
  • 可使用全谱或谱图区域，谱峰，谱图参数，化学结构和子结构，分子式，分子量，参考文献，和用户数据检索数据库
  • 谱图检索基于Euclidean 偏差，方差或绝对偏差. 检索结果按HQI(命中相似度指数)排序
  • 一键生成全面的报告和可供发表的图片图表

Structure Elucidator Suite提供了一个不依赖供应商的软件平台，可以对结构解析所需要的所有分析技术数据进行完整的处理.

  • 使用同一软件界面处理不同分析技术的数据
  • 分析数据:
    • MS: 解析谱图，确认分子式，检索光谱数据库获得位置结构信息
    • 色谱：平滑，校正基线，标峰，积分
    • 光谱：校正基线，标峰，平滑曲线
  • 自动化的日常数据处理工作流程

Compatible with All Your Instruments and Techniques

See All Supported Formats
More Reasons to Use Structure Elucidator Suite

为什么使用计算机来解析结构

计算机辅助结构解析(CASE)系统极大易化了从头结构解析工作，特别当传统(人工)方法解析结构遇到挑战或失败的时候.

计算机辅助结构解析(CASE)系统极大易化了从头结构解析工作，特别当传统(人工)方法解析结构遇到挑战或失败的时候.

随着化合物结构变得更大更复杂，可能的异构体数目呈指数增长。 虽然解析6-8个碳原子的结构还不是问题，但随着碳原子数量的增加，这项工作变得极具挑战性。 例如，用一种无偏向性的方法来鉴定一个含有30个碳的化合物意味着要考虑几十亿个可能的同分异构体。 加上考虑化学知识，你仍然可能需要考察成百上千种可能的结构。 如果结构中存在异核原子，可能的结构组合数目将进一步增大。 无论您的专业水平如何，人工解析将是一相非常艰巨的任务.

此外，最佳结构和次佳结构可能只是略有不同，这使得在没有化学智能软件的帮助下很难将他们加以区分.

CASE可以确保没有忽略所有潜在的候选结构，并考虑所有的结构可能性。相比于人工解析来讲，Structure Elucidator使用化学位移预测选择最可能的结构所需的时间短.

Structure Elucidator Tutorial

Try the free structure elucidation tutorial with included example data. This limited version is available to introduce computer-assisted structure elucidation (CASE). For best results, use the software as an accompaniment to the book “Computer-Based Structure Elucidation from Spectral Data,” by M. Elyashberg and A. Williams.

Note: This tutorial package includes all the processing and interpretation functionality of Structure Elucidator Suite, but you will not be able to import new analytical data/spectra or save results to the database. This software is for educational use only.

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What's New!

2022版Structure Elucidator Suite新功能

  • Sort stereoisomers by Q-factor after fitting RDCs to conformers
  • Improved peak intensity scaling for HMBC and COSY Spectra
  • You can now review the reasons for inconsistencies found in manually entered spectral data
  • Improved structural fragment handling features

Read the Full List of What’s New

Learn More about Structure Elucidator Suite

Additional resources are available on our English web site

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